Говорят, что, исполняя эту мелодию на флейтах и свирелях, древние инки просили у богов дождя. Первые упоминания о композиции, которую впоследствии назвали El Condor Pasa, появились еще в 18 веке. В 1913 году перуанский композитор Даниэль Роблес первым записал ее с помощью нот и включил в свою сарсуэлу (нечто вроде южноамериканской разновидности оперетты). Роблес назвал это сценическое действо El condor pasa. Мировую известность «Полету кондора» принесли американские музыканты Пол Саймон и Арт Гарфанкел.