Марат Камболов родился 2 января 1965 года в селе Хазнидон Ирафского района Северо-Осетинской АССР в семье Аркадия и Екатерины Камболовых. Его отец работал в совхозе, а мать — в местной библиотеке. У них было шестеро детей. В том же селе вырос бизнесмен, основатель пивоваренной компании «Балтика» Таймураз Боллоев. Его семья была дружна с Камболовыми. Боллоев описывал родителей Камболова как «внешне и душой красивых», улыбчивых людей. Уже став главой Курчатовского института, Камболов открыл в родном селе два Курчатовских класса. Он также принимал участие в восстановлении старинных склепов в Хазнидоне и строительстве мечети.